matplotlib一维散点分布图的实现

目录

• 引言
• 方法
• 测试结果
• 参考

引言

本次的目标是k">绘制数据的一维散点分布图，应用场景是数据一维标签的聚类可视化，假定我们拥有原始的带标签数据 ( X , y ) (X,y) (X,y)其中 X X X为样本特征矩阵， y y y为对应样本的标签（连续值），通过聚类算法得到了 X X X的伪分类标签 y ^ , y ^ ∈ ( 1 , 2 , . . . , N ) \hat{y}, \hat{y}\in(1,2,…,N) y^​,y^​∈(1,2,…,N)，想要绘制出相同类别样本在标签值是否同样是集中的。
值得注意的是，由于我们可能获得多类样本，因此仅仅使用一张图来进行绘制可能会使得不同类别样本的marker在图上相互重叠，因此需要为每一类样本单独绘制一维散点分布图，并在同一张画布上显示。

方法

为了显示一维的单张散点分布图，我们需要对matplotlib默认的二维画布进行调整，将其余三条轴线都设置为不可见，只保留底部的轴线，进一步的，要把纵轴label的位置向图左端移动（否则在横轴包括负半轴时，label会出现在图中央），实例代码如下：

axs.spines['top'].set_visible(False)
axs.spines['right'].set_visible(False)
axs.spines['left'].set_visible(False)
axs.yaxis.set_ticks_position('left')
axs.set_xlim((-0.05,1.05))
axs.set_ylim((0,1))
axs.set_yticks([0],labels=['score'])

对于多张一维散点图的绘制，只需要利用subplot函数，对子图重复进行上述操作即可。整体代码如下：

def score_distr(group,x_lim=(-0.1,1.1),y_lim=(-0.1,1.1)):
    '''
    可视化N个类别中每个样本的y分布
    :param group: List[np.ndarray], N类样本标签y组成的数组
    :param x_lim: 横坐标区间
    :param y_lim: 纵坐标区间
    :return:
    '''
    group_num=len(group)
    color_map=["violet","tomato","cyan","salmon","limegreen"]
    fig,axs=plt.subplots(group_num,1)
    dem_labels=[]
    for i in range(group_num):
        axs[i].scatter(group[i],[0.05]*group[i].shape[0],label="class_"+str(i),c=color_map[i])
        # axs[i].xlim(x_lim)
        dem_labels.append("class_"+str(i))
        axs[i].spines['top'].set_visible(False)
        axs[i].spines['right'].set_visible(False)
        axs[i].spines['left'].set_visible(False)
        axs[i].yaxis.set_ticks_position('left')
        axs[i].set_xlim(x_lim)
        axs[i].set_ylim(y_lim)
        axs[i].set_yticks([0],labels=['score'])
    fig.legend(dem_labels,loc=(0.45,0.85))

测试结果

给出示例代码及对应结果如下：

test=[]
for i in range(3):
    test.append(np.random.rand(15))
score_distr(test,x_lim=(-1.05,1.05))

结果：

参考

可视化: Python—MatPlotLib—一维散点图

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